Offre d'emploi DATA MANAGER H/F - AURAGEN - - HCL Hospices Civils de Lyon

Offre d'emploi

Offre d'emploi DATA MANAGER H/F - AURAGEN - - HCL Hospices Civils de Lyon

Annonce déposée le jeudi 02 août 2018 à 10h38

Etablissement

HCL Hospices Civils de Lyon
3 Quai des Celestins BP 2251
69229 Lyon

Site géographique de l'offre

HCL Hospices Civils de Lyon
3 Quai des Celestins BP 2251
69229 Lyon

Détail de l'offre

Poste proposé
DATA MANAGER H/F - AURAGEN -
Contrat(s)
CDI;Détachement;Mutation
Descriptif

ÉTABLISSEMENT
AURAGEN AUvergne Rhône-Alpes Génomique
PLATEFORME DE SEQUENÇAGE TRES HAUT DEBIT A VISEE SANITAIRE
Groupement Hospitalier Centre
Bâtiment 7
5 Place d’ARSONVAL
69003 LYON cedex 03
CARACTÉRISTIQUES GÉNÉRALES DU SERVICE/LABORATOIRE
La plateforme de séquençage très haut débit à visée sanitaire, localisée sur l’hôpital Edouard Herriot, a pour objectif de produire à terme 18 000 équivalents génomes dans le cadre du projet AURAGEN : Auvergne Rhône Alpes Genomique. Le projet AURAGEN est un des deux projets retenus dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG2025). Cette plateforme aura pour mission de recevoir les prélèvements, extraire les acides nucléiques (ADN et/ou ARN), préparer les librairies, et réaliser le séquençage d’exomes, de transcriptomes ou de génomes entiers.
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DÉFINITION GÉNÉRALE DU POSTE
 Le Data manager de la plateforme AURAGEN aura pour mission principale de s’assurer de la qualité des données produites en exome, transcriptome et génome entier (WES, RNAseq, WGS). Il gérera également les bases de données et les interactions avec l’axe pré-analytique et post analytique.
PRINCIPALES ACTIVITÉS DU POSTE
1) Analyser les données qualités tout au long du processus technique et en particulier pour valider la qualité des séquences obtenues avant analyse sur le cluster de calcul du CHU de Grenoble.
2) Travailler sur les données générées par la plateforme de production AURAGEN
3) Faire les calculs statistiques pour les bilans pour les instances
4) Faire des statistiques sur le processus technique afin de détecter des dérives et optimiser le cout des séquences
5) Formation d’étudiants, de stagiaires…
LIENS HIERARCHIQUES
 Le cadre de santé
 Le cadre supérieur de santé
LIENS FONCTIONNELS
 Les responsables médicaux et techniques de la plateforme
 Les biologistes impliqués dans les différentes activités
 Les ingénieurs qualité, informatique, …
 Le cadre de santé
DIPLOMES ET CONNAISSANCES ASSOCIÉES
 Titulaire au minimum d’un BTS ou équivalent (VAE) avec expérience dans la gestion de données
 Connaissance des systèmes d’exploitation Linux/Unix, Windows,
 Maitrise de quelques langages de script.
 Bonne maitrise d’Excel ou d’autres logiciels de base de données
 Si possible avoir une expérience dans la gestion de données de séquençage
 Avoir déjà travaillé avec des informaticiens ou bio-informaticiens est un plus.
 Capacité à discuter avec différents professionnels : biologistes, techniciens, secrétaires, bio informaticien, bio-informaticien…
 Connaissances des règles d’hygiène et de sécurité au travail
QUALITÉS REQUISES
 Capacité à communiquer et s’adapter au travail en équipe
 Connaissance de l’anglais technique
 Sens de l’organisation et rigueur méthodologique
 Sens des responsabilités et esprit d’initiative
 Précision, rigueur dans l’organisation et l’exécution du travail
 Capacités à suivre des instructions de travail
 Conscience professionnelle
 Disponibilité, autonomie
 Respect du secret professionnel
 Respect des règles de qualité et de sécurité (Norme ISO 15189 ou BPL, risques professionnels, …)
 Capable de faire un retour synthétique du travail effectué et des difficultés rencontrées
 Intérêt pour les sciences biologiques et plus particulièrement pour la génétique
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CONDITIONS DE TRAVAIL - EVOLUTION DU POSTE
Poste à 100%, 37H30/semaine Poste à repos fixe
Soit 7H30/jour (+ 20 mn de repas) + 28 CA/an + 15 RTT/an, (journée de solidarité à déduire)
Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8H00 à 18H00
Week-end :
- Possible travail le Week-end en fonction de l’évolutivité de l’activité et des contraintes dues aux équipements
Transmission par mail à :
nicole.eyraud@chu-lyon.fr
damien.sanlaville@chu-lyon.fr
avec copie à : sihem.kheddouci@lyoningenierie.fr

Personne à contacter
Madame Nicole EYRAUD
Directrice Adjointe
Référente Pôle Biologie ACP
Email : nicole.eyraud@chu-lyon.fr

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