Offre d'emploi admistration système - Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes

Offre d'emploi

Offre d'emploi admistration système - Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes

Annonce déposée le vendredi 16 novembre 2018 à 17h48

Etablissement

Centre Hospitalier Universitaire Grenoble Alpes
Boulevard de la Chantourne 38700 La Tronche CS 10217
38043 Grenoble

Site géographique de l'offre

CHU Grenoble Alpes - Site NORD
boulevard de la chantourne CS 10217 38043 Grenoble CEDEX 9
38700 La Tronche
Visiter le site de l'établissement

Détail de l'offre

Poste proposé
admistration système
Contrat(s)
CDD
Descriptif

un poste d'administration système est à pourvoir sur le CHU Grenoble Alpes dans le cadre du projet AURAGEN

CARACTÉRISTIQUES GÉNÉRALES DU SERVICE/LABORATOIRE
La plateforme de séquençage très haut débit à visée sanitaire a pour objectif de produire à terme 18 000
équivalents génomes dans le cadre du projet AURAGEN : Auvergne Rhône-Alpes Génomique. Le projet
AURAGEN est un des deux projets retenus dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025
(PFMG2025). Cette plateforme aura pour mission de recevoir les prélèvements, extraire les acides nucléiques
(ADN et/ou ARN), préparer les librairies, et réaliser le séquençage d’exomes, de transcriptomes ou de génomes
entiers
La plateforme d’analyse bioinformatique AURAGEN est coordonnée par les équipes du Centre Léon Bérard et
du Centre Hospitalier Universitaire Grenoble-Alpes. Elle a pour objectif de gérer le flux de données, l’archivage,
l’analyse et la mise à disposition d’outil pour permettre l’interprétation médicale des données génomiques.

DÉFINITION GÉNÉRALE DU POSTE
La personne en charge de l’administration système aura la responsabilité de suivre la mise en place de l’infrastructure de calcul, de stockage et d’analyse du projet AURAGEN, en lien avec les partenaires industriels.

Elle/Il sera ensuite responsable de maintenir en conditions opérationnelles l’architecture de calcul haute
performance AURAGEN qui accueillera quotidiennement un grand flux de données et d’analyses génomiques.

PRINCIPALES ACTIVITÉS DU POSTE
• Maintien en conditions opérationnelles du système en lien avec le prestataire industriel
• Mise en œuvre des indicateurs qualité du système et construction des tableaux de bord de ces indicateurs
• Veiller à l’intégrité, la sécurité, la confidentialité des échanges et des données
• Améliorer en continu la qualité, l’exploitabilité, la performance et la résilience de l’architecture
• Gérer des problèmes techniques complexes et assurer l’escalade auprès des fournisseurs
• Assurer la rédaction d’un journal d’administration
• Assurer un support aux utilisateurs en termes de matériel et de logiciels
• Participation essentielle aux choix technologiques et au design de l’architecture logicielle
• Responsable de l’administration des environnements de virtualisation et containerisation
• Participation active à l’automatisation et l’optimisation des processus d’exploitation et de livraison des
applicatifs métiers
• Participation à la gestion et l’organisation du travail sur la plateforme bio-informatique
LIENS HIERARCHIQUES
• Les pilotes de la plateforme bio-informatique

LIENS FONCTIONNELS
• Les responsables médicaux et organisationnels de la plateforme
• Les informaticiens impliqués dans les différentes activités
• Le(s) partenaire(s) industriel(s) du projet AURAGEN/FMG2025
DIPLOME, CONNAISSANCES, COMPETENCES ET QUALITES ASSOCIÉES

• Diplôme :
Diplôme d’ingénieur en informatique avec 2 ans minimum d’expérience professionnelle.
• Compétences requises
Administration des systèmes d’exploitation Linux/Unix
Administration légère d’un système de gestion de bases de données
Protocoles et services réseaux
Bonne connaissance des annuaires informatique
Expérience en calcul HPC et connaissance des technologies associées :
▪ Ordonnancement : SLURM, Torque, …
▪ Systèmes de fichiers parallèles : GPFS, BeeGFS, Lustre, …
Gestion des systèmes et procédures de sauvegarde et d’archivage
Virtualisation (VMware, … ) et containerisation (Docker, … )
• Compétences appréciées mais non requises
Connaissances en administration des systèmes d’exploitation Windows

Connaissance en technologies « Big Data » et bases NoSQL (HBase, Hadoop, MongoDB, … )
Notions de bioinformatique et/ou de génomique
• Capacités organisationnelles et interpersonnelles
Motivation et dynamisme
Organisation et rigueur
Autonomie et travail en équipe
Aptitude à communiquer/vulgariser son travail

Personne à contacter
Faire parvenir LM+CV à
JThevenon@chu-grenoble.fr
avec copie à
Alain.Viari@inria.fr
anthony.ferrari@lyon.unicancer.fr
sihem.kheddouci@lip-lyon1.fr

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